ஜர்னல் ஆஃப் அப்ளைடு பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ் & கம்ப்யூடேஷனல் பயாலஜி

ஹோமோலஜி மாடலிங்

ஹோமோலஜி மாடலிங், இல்லையெனில் புரதத்தின் ஒப்பீட்டு மாடலிங் என்று அழைக்கப்படுகிறது, அதன் அமினோ அரிக்கும் வரிசையிலிருந்து "புறநிலை" புரதத்தின் அணுக்கரு நிர்ணய மாதிரியை உருவாக்குவதைக் குறிக்கிறது. ஹோமோலஜி மாடலிங்கில் தொடர்புடைய ஹோமோலோகஸ் புரதத்தின் ("தளவமைப்பு") முப்பரிமாண அமைப்பைச் சோதிக்கிறோம். "ஹோமோலஜி டெமான்ஸ்ட்ரேட்டிங்" என்ற வெளிப்பாடு, கூடுதலாக ஒத்த காட்சிப்படுத்தல் அல்லது வடிவமைப்பு அடிப்படையிலான காட்சிப்படுத்தல் (TBM) என அழைக்கப்படுகிறது, இது ஒரு ஹோமோலோகஸ் புரதத்தின் அறியப்பட்ட தற்காலிகமாக தீர்மானிக்கப்பட்ட கட்டமைப்பை ஒரு தளவமைப்பாகப் பயன்படுத்தி ஒரு புரத 3D கட்டமைப்பை நிரூபிப்பதைக் குறிக்கிறது.

புரதத் திறன், முன்னேற்றம், தசைநார்கள் மற்றும் பல்வேறு புரதங்களுடனான கூட்டுப்பணிகள் மற்றும் மருந்துத் துறையின் உள்ளேயும் கூட கட்டமைப்பு அடிப்படையிலான மருந்து வெளிப்பாடு மற்றும் மருந்து அவுட்லைன் ஆகியவற்றின் ஆய்வுக்கு ஒரு புரதக் கட்டமைப்பு நம்பத்தகுந்த உதவியாக உள்ளது. ஹோமோலஜி காட்சிப்படுத்தல் அணு ஆராய்ச்சியாளர் மற்றும் கரிம வேதியியலாளர்களுக்கு "குறைந்த-உறுதியான" கட்டமைப்புகளை வழங்க முடியும், இது புரதத்தில் உள்ள அத்தியாவசிய வைப்புகளின் இடஞ்சார்ந்த போக்கைப் பற்றிய போதுமான தரவுகளைக் கொண்டிருக்கும் மற்றும் புதிய ஆய்வுகளின் வெளிப்புறத்தை வழிநடத்தும்.

உதாரணமாக, அத்தகைய "குறைந்த-நிர்ணயம்" மாதிரி கட்டமைப்புகள் பயன்படுத்தப்பட்டால், தள-ஒருங்கிணைந்த பிறழ்வு பகுப்பாய்வுகளின் வெளிப்புறத்தை கணிசமாக மேம்படுத்த முடியும். புரதக் கட்டமைப்பின் சோதனை விளக்கமானது, புரதத்தின் போதுமான அளவைப் பெறுவதில் உள்ள சிக்கல்களால் (குளோனிங், வெளிப்பாடு மற்றும் மில்லிகிராம் அளவுகளை தூய்மையாக்குதல்), படிகமயமாக்கலுடன் தொடர்புடைய சவால்களால் ஒத்திவைக்கப்படலாம், மேலும் புரத படிகவியல் பகுதியும் கூட சிக்கல்களின் ஊற்றாக மாறக்கூடும். இந்த அமைப்பில், புரோட்டீன் கட்டமைப்பின் முன்னறிவிப்பை நிர்வகிக்கும் அமைப்புகள் அதிக பொழுதுபோக்கை அதிகரித்திருப்பது ஆச்சரியமாக இல்லை. இந்த நுட்பங்களில், ஹோமோலஜியை அடிக்கடி காண்பிக்கும் உத்தி மிகவும் நம்பகமான முடிவை அளிக்கிறது. இந்த நுட்பத்தின் பயன்பாடானது, இரண்டு புரதங்கள் ஒரே குடும்பத்துடன் ஒரு இடத்தைக் கொண்டிருப்பது மற்றும் ஒப்பீட்டு அமினோ அரிக்கும் வாரிசுகளைக் கொண்டிருப்பது, ஒப்பீட்டு முப்பரிமாண அமைப்புகளைக் கொண்டிருக்கும்.