ஜர்னல் ஆஃப் அப்ளைடு பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ் & கம்ப்யூடேஷனல் பயாலஜி

வரிசை பகுப்பாய்வு

வரிசை பகுப்பாய்வு என்பது உயிரியல் ஆராய்ச்சியின் ஒரு துறையாகும், இதில் தனித்துவமான வாழ்க்கை வடிவங்களின் மரபணு கூறுகள் பார்க்கப்படுகின்றன. வரிசை பகுப்பாய்வு வரிசை சீரமைப்பு, டிஎன்ஏ குழு மற்றும் பிற மரபணு கட்டமைப்பு அடையாளங்களை உள்ளடக்கியிருக்கலாம். கைமுறை வரிசைமுறையில், பதில் நான்கு தனித்துவமான குழாய்களில் நிகழ்கிறது, ஒவ்வொன்றும் ஒரு மாற்று ddNTP ஐக் கொண்டுள்ளது. அதன்படி, ddATP ஐக் கொண்டிருக்கும் குழாயானது அடினோசின் (A) இல் முடிவடையும் பிரிவுகளைக் கொண்டிருக்கும், ddGTP கொண்ட குழாய் குவானைன் (G) மற்றும் பலவற்றுடன் முடிவடையும் துண்டுகளைக் கொண்டிருக்கும்.

நான்கு குழாய்களில் உள்ள பொருட்கள் ஜெல்லின் இணையான பாதையில் இயங்கிக் கொண்டே இருக்கும். வலதுபுறத்தில் உள்ள படம் கைமுறை வரிசைமுறையின் விளைவுகளை நிரூபிக்கிறது. டிஎன்ஏ வரிசைமுறையின் முடிவுகள், பூர்வாங்கமானது கதிரியக்கக் குறியுடன் பெயரிடப்பட்டிருப்பதன் வெளிச்சத்தில் கற்பனை செய்யலாம். ஒரு பிட் எக்ஸ்-பீம் ஃபிலிமுக்கு வழங்கப்பட்ட போது, ​​கதிரியக்கத்தன்மை படம் ஒரு மந்தமான இசைக்குழுவாக தோன்றியதைக் கண்டறிந்தது. வாரிசு பின்னர் திரைப்படத்திலிருந்து விஞ்ஞானி அல்லது நிபுணரால் ஆராயப்படுகிறது. வரிசையின் முடிவுகள் ஒரு ஜெல்லில் நான்கு இணையான பாதைகளில் அடுக்கி வைக்கப்பட்டுள்ளன. இந்த விளக்கப்படத்தில், முதல் பாதையில் ddCTP உள்ள பதிலில் இருந்து உருப்படிகள் உள்ளன.

இந்த முறையில், அந்த பாதையில் தோன்றும் ஒவ்வொரு இசைக்குழுவும் C இல் முடிவடையும் ஒரு வரிசைமுறை உருப்படியைப் பேசுகிறது. ஜெல் வரிசைப்படுத்தும் உருப்படிகளை கணக்கின் அளவைக் கொண்டு தனிமைப்படுத்துகிறது; சிறிய பகுதிகள் ஜெல் வழியாக விரைவாக செல்கின்றன, அதைவிட அதிகமான துண்டுகள். நான்கு பாதைகளும் அடிவாரத்திலிருந்து (சிறியது) அடிப்பது (பெரியது) வரை ஒரு நிலை பரம்பரையில் ஒன்றாகப் பார்க்கப்படுகின்றன. குழுக்கள் கவனிக்கப்பட வேண்டும் என்ற கோரிக்கையை நீலக் கோடு பின்பற்றுகிறது மற்றும் பிரிவின் வாரிசு பக்கத்தில் நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளது. இயந்திரமயமாக்கப்பட்ட வரிசைமுறையின் பதில் அடிப்படையில் கைமுறை வரிசைமுறையைப் போலவே இருக்கும்.

இரண்டு முதன்மை முரண்பாடுகள் உள்ளன: குறியிடுதல் மற்றும் ஆய்வு செய்தல். கணினிமயமாக்கப்பட்ட வரிசைமுறையில், பொருட்கள் கதிரியக்கப் பெயருக்குப் பதிலாக ஒளிரும் வண்ணத்துடன் குறிக்கப்படுகின்றன. நான்கு ஒளிரும் வண்ணங்கள் உள்ளன, ஒவ்வொன்றும் ஒரு மாற்று ddNTP உடன் ஒப்பிடப்படுகிறது; ddATP பச்சை, ddTTP சிவப்பு, ddCTP நீலம் மற்றும் ddGTP மஞ்சள். இந்த முறையில் ஒவ்வொரு பகுதியும் அதன் இறுதித் தொடர்ச்சியில் ஒரு மாற்று நிழலைக் கொண்டுள்ளது, அதன் முடிவில் நியூக்ளியோடைடு (ddNTP) உள்ளது. இது வரிசைப்படுத்தலின் முடிவுகளை ஒரு ஜெல்லின் தனிப் பாதையில் தொடர்ந்து நான்கு இணையான பாதைகளில் தொடர்ந்து இயங்க அனுமதிக்கிறது.