கடுமையான ஒருங்கிணைந்த நோயெதிர்ப்பு குறைபாடு ஒரு முதன்மை நோயெதிர்ப்பு குறைபாடு ஆகும். வரையறுக்கும் பண்பு பொதுவாக T- & B-லிம்போசைட் அமைப்புகளில் கடுமையான குறைபாடு ஆகும். இது பொதுவாக வாழ்க்கையின் முதல் சில மாதங்களில் ஒன்று அல்லது அதற்கு மேற்பட்ட தீவிர நோய்த்தொற்றுகளின் தொடக்கத்தில் விளைகிறது. எஸ்சிஐடியை ஏற்படுத்தக்கூடிய குறைந்தது 13 வெவ்வேறு மரபணு குறைபாடுகள் உள்ளன. இந்த குறைபாடுகள் மிகவும் தீவிரமான தொற்றுநோய்களுக்கு மிகவும் எளிதில் பாதிக்கப்படுகின்றன. SCID இன் மிகவும் பொதுவான வடிவம் X குரோமோசோமில் அமைந்துள்ள SCIDX1 மரபணுவில் ஏற்படும் மாற்றத்தால் ஏற்படுகிறது.