கால்நடை அறிவியல் & மருத்துவக் கண்டறிதல் இதழ்

பன்றி தொப்புள் நரம்பு எண்டோடெலியல் செல்கள் கிளாசிக்கல் ஸ்வைன் ஃபீவர் வைரஸ் தொற்றுக்கான பதிலளிப்பு பொறிமுறையை ஆராய்வதற்கான ஆழமான வரிசைமுறை தரவுத்தளத்தின் அடிப்படையில் டென்சி கிளஸ்டர் பகுப்பாய்வு

Xiaocheng Gong, Xin You, Xuepeng Li, Aoxue Hu, Zhongxing Wu, Jun He and Pengbo Ning

கிளாசிக்கல் பன்றிக் காய்ச்சலை (CSF) ஏற்படுத்தும் கிளாசிக்கல் ஸ்வைன் ஃபீவர் வைரஸ் (CSFV) நோய்த்தொற்றின் முக்கிய இலக்குகளில் எண்டோடெலியல் செல் ஒன்றாகும். CSF இன் நோய்க்கிருமி உருவாக்கம் நீண்ட காலமாக ஆய்வு செய்யப்பட்டாலும், அடிப்படை பொறிமுறையை தெளிவுபடுத்துவதற்கு புதிய முறை இன்னும் தேவைப்படுகிறது. ஆழமான வரிசைமுறையின் அடிப்படையிலான மரபியல் பகுப்பாய்வு CSFV தொற்று பொறிமுறையின் மேலதிக ஆய்வுகளுக்கான வாய்ப்பை வழங்குகிறது. இந்த வேலையில் CSFV க்கு எண்டோடெலியல் செல்களின் குறிப்பிடத்தக்க மரபணு பதில்களை விளக்குவதற்காக டென்சி கிளஸ்டர் பகுப்பாய்வு மற்றும் உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு உருவாக்கப்பட்டன. CSFV Shimen க்கு பங்களித்த முக்கிய மரபணுக்கள் CSFV C தொற்று மற்றும் கட்டுப்பாட்டிலிருந்து வேறுபட்டதாக அடையாளம் காணப்பட்டன. GO (ஜீன் ஆன்டாலஜி) மற்றும் KEGG பகுப்பாய்வு CSFV Shimen தொற்று NF-kappaB இன் சைட்டோபிளாஸ்மிக் சீக்வெஸ்டரிங், அப்போப்டொடிக் செயல்முறையை ஒழுங்குபடுத்துதல் மற்றும் டோல் போன்ற ஏற்பி 4 சமிக்ஞை பாதை போன்ற உயிரியல் செயல்முறைகளில் மாற்றங்களை ஏற்படுத்தியது என்று பரிந்துரைத்தது. PI3K-Akt சிக்னலிங் பாதை, வைரஸ் மயோர்கார்டிடிஸ், ப்ரோலாக்டின் சிக்னலிங் பாதை மற்றும் பலவற்றிலிருந்து ஷிமென் தொற்றுநோய்களின் போது குறிப்பிடத்தக்க பதில் இருந்தது. ஆழமான வரிசைமுறை தரவுத்தளத்திற்கான தொடர்-கிளஸ்டரை அடிப்படையாகக் கொண்ட போக்கு பகுப்பாய்வு CSFV ஷிமனுக்கு சிறந்த விளக்கத்தைப் பெற்றது, இது CSF இன் வளர்ச்சியைப் புரிந்துகொள்வதற்கு மிகவும் மதிப்புமிக்க தகவலை வழங்கியது.